據我國目前的AEO制度建構，企業(yè)信用等級不同，適用的通關待遇與監(jiān)管要求也存在差異。海關的總體管理原則為“誠信守法便利、失信違法懲戒”，對AEO企業(yè)適用通關便利措施，對一般信用企業(yè)適用常規(guī)管理措施，對失信企業(yè)則適用嚴密監(jiān)管措施。 

與此同時，依托國家信用體系建設機制，海關還會將AEO企業(yè)通報各相關管理部門，實施聯合激勵措施；將失信企業(yè)通報各相關管理部門，對失信企業(yè)實施協調治理和聯合懲戒。換言之，AEO企業(yè)不單單享有通關便利，在各個管理部門更是一路綠燈，能夠令其競爭優(yōu)勢得到最大的發(fā)揮；而一旦被認定為失信企業(yè)，企業(yè)將面臨“一處失信，處處受限”的局面。 

據統計，我國AEO企業(yè)共計40,364家，其中高級認證企業(yè)3,306家，約占全國海關注冊企業(yè)總數的0.5%。與此同時，雖然一般認證企業(yè)與高級認證企業(yè)均屬于AEO企業(yè)，單就目前與我國前述AEO互認安排的4個國家（地區(qū)）而言，互認范圍還僅限于高級認證企業(yè)。而本著簡政放權、轉變職能的精神，海關將高級認證企業(yè)的評定時間縮短至90日，進出口企業(yè)申請高級認證企業(yè)可謂正當時。

根據《海關認證企業(yè)標準》的要求，高級認證企業(yè)總體包括內部控制、財務狀況、守法規(guī)范、貿易安全和附加標準共計5大類18條32項指標，認證基礎分數為100分，達標記為0分，部分達標以及不達標分別記為-1和-2分，企業(yè)如要通過高級認證，需逐項對自我展開評估核查，經海關審核所有項目不存在不達標情形且最后認證標準總分達95分以上。

由于AEO的適用范圍不僅僅限于海關部門，還會涉及工商、商務、稅務、外管、公安、檢驗檢疫等部門，故而在對AEO進行審核判斷時，海關的關注點也不拘于企業(yè)的進出口業(yè)務，因此AEO認證工作需要企業(yè)內部各部門間的整體配合協調。